Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA4P35212 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA4P35212 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA4P35212 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA4P35212 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA4P35212 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA4P35212 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA4P35212 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA4P35212 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA4P35212 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA4P35212 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA4P35212 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA4P35212 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA4P35212 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA4P35212 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA4P35212 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA4P35212 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA4P35212 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA4P35212 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA4P35212 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA4P35212 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA4P35212 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA4P35212 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA4P35212 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA4P35212 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA4P35212 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA4P35212 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA4P35212 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA4P35212 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA4P35212 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA4P35212 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA4P35212 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA4P35212 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA4P35212 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA4P35212 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GJA4P35212 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GJA4P35212 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GJA4P35212 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GJA4P35212 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJA4P35212 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJA4P35212 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJA4P35212 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJA4P35212 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJA4P35212 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJA4P35212 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA4P35212 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA4P35212 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA4P35212 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA4P35212 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA4P35212 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA4P35212 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA4P35212 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA4P35212 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA4P35212 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA4P35212 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA4P35212 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA4P35212 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA4P35212 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA4P35212 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA4P35212 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA4P35212 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA4P35212 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA4P35212 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA4P35212 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA4P35212 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA4P35212 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA4P35212 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA4P35212 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA4P35212 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA4P35212 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA4P35212 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA4P35212 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA4P35212 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA4P35212 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA4P35212 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA4P35212 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA4P35212 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA4P35212 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA4P35212 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA4P35212 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA4P35212 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA4P35212 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA4P35212 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA4P35212 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA4P35212 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA4P35212 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA4P35212 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA4P35212 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA4P35212 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA4P35212 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA4P35212 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA4P35212 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA4P35212 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA4P35212 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA4P35212 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA4P35212 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA4P35212 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA4P35212 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA4P35212 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA4P35212 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms