Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD34P28906 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD34P28906 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD34P28906 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD34P28906 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD34P28906 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD34P28906 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD34P28906 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD34P28906 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD34P28906 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD34P28906 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD34P28906 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD34P28906 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CD34P28906 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD34P28906 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD34P28906 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD34P28906 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD34P28906 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD34P28906 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD34P28906 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD34P28906 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CD34P28906 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CD34P28906 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD34P28906 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD34P28906 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD34P28906 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD34P28906 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD34P28906 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD34P28906 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD34P28906 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD34P28906 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD34P28906 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD34P28906 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD34P28906 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD34P28906 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD34P28906 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD34P28906 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD34P28906 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD34P28906 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD34P28906 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD34P28906 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD34P28906 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD34P28906 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD34P28906 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD34P28906 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD34P28906 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD34P28906 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD34P28906 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD34P28906 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD34P28906 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD34P28906 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD34P28906 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD34P28906 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD34P28906 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD34P28906 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD34P28906 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD34P28906 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD34P28906 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD34P28906 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD34P28906 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD34P28906 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD34P28906 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD34P28906 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD34P28906 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD34P28906 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD34P28906 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD34P28906 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD34P28906 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD34P28906 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CD34P28906 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD34P28906 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD34P28906 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD34P28906 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD34P28906 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD34P28906 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CD34P28906 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CD34P28906 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CD34P28906 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CD34P28906 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD34P28906 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD34P28906 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD34P28906 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD34P28906 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CD34P28906 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CD34P28906 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD34P28906 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD34P28906 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD34P28906 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD34P28906 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD34P28906 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD34P28906 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD34P28906 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD34P28906 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD34P28906 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD34P28906 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD34P28906 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CD34P28906 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD34P28906 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD34P28906 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD34P28906 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms