Protein–RNA interactions for Protein: P28476

GABRR2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-2, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR2P28476 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABRR2P28476 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABRR2P28476 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABRR2P28476 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABRR2P28476 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GABRR2P28476 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABRR2P28476 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABRR2P28476 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABRR2P28476 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABRR2P28476 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABRR2P28476 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABRR2P28476 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRR2P28476 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRR2P28476 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRR2P28476 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRR2P28476 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRR2P28476 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRR2P28476 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRR2P28476 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRR2P28476 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRR2P28476 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRR2P28476 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRR2P28476 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRR2P28476 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRR2P28476 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRR2P28476 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRR2P28476 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRR2P28476 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRR2P28476 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRR2P28476 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRR2P28476 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRR2P28476 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRR2P28476 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRR2P28476 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRR2P28476 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRR2P28476 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRR2P28476 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRR2P28476 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRR2P28476 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRR2P28476 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRR2P28476 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRR2P28476 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRR2P28476 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRR2P28476 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRR2P28476 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRR2P28476 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABRR2P28476 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABRR2P28476 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABRR2P28476 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABRR2P28476 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABRR2P28476 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABRR2P28476 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABRR2P28476 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABRR2P28476 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABRR2P28476 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABRR2P28476 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABRR2P28476 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GABRR2P28476 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABRR2P28476 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABRR2P28476 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABRR2P28476 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABRR2P28476 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABRR2P28476 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABRR2P28476 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GABRR2P28476 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GABRR2P28476 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABRR2P28476 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GABRR2P28476 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABRR2P28476 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GABRR2P28476 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GABRR2P28476 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GABRR2P28476 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRR2P28476 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRR2P28476 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRR2P28476 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRR2P28476 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRR2P28476 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRR2P28476 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRR2P28476 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRR2P28476 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRR2P28476 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRR2P28476 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRR2P28476 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRR2P28476 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRR2P28476 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRR2P28476 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRR2P28476 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABRR2P28476 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABRR2P28476 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABRR2P28476 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABRR2P28476 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABRR2P28476 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABRR2P28476 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABRR2P28476 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GABRR2P28476 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GABRR2P28476 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABRR2P28476 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABRR2P28476 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABRR2P28476 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABRR2P28476 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms