Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms