Protein–RNA interactions for Protein: P24046

GABRR1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-1, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR1P24046 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GABRR1P24046 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GABRR1P24046 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GABRR1P24046 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GABRR1P24046 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRR1P24046 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GABRR1P24046 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GABRR1P24046 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GABRR1P24046 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GABRR1P24046 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GABRR1P24046 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GABRR1P24046 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GABRR1P24046 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms