Protein–RNA interactions for Protein: P23560

BDNF, Brain-derived neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BDNFP23560 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BDNFP23560 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BDNFP23560 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BDNFP23560 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BDNFP23560 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BDNFP23560 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BDNFP23560 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BDNFP23560 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BDNFP23560 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BDNFP23560 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BDNFP23560 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BDNFP23560 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BDNFP23560 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
BDNFP23560 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BDNFP23560 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BDNFP23560 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BDNFP23560 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BDNFP23560 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BDNFP23560 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BDNFP23560 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BDNFP23560 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BDNFP23560 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BDNFP23560 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BDNFP23560 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BDNFP23560 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BDNFP23560 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BDNFP23560 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BDNFP23560 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BDNFP23560 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BDNFP23560 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BDNFP23560 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BDNFP23560 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BDNFP23560 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BDNFP23560 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BDNFP23560 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BDNFP23560 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BDNFP23560 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BDNFP23560 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BDNFP23560 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BDNFP23560 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
BDNFP23560 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BDNFP23560 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
BDNFP23560 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BDNFP23560 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BDNFP23560 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BDNFP23560 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
BDNFP23560 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BDNFP23560 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BDNFP23560 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BDNFP23560 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BDNFP23560 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BDNFP23560 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BDNFP23560 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BDNFP23560 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BDNFP23560 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BDNFP23560 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BDNFP23560 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BDNFP23560 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BDNFP23560 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BDNFP23560 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BDNFP23560 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BDNFP23560 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BDNFP23560 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BDNFP23560 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BDNFP23560 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BDNFP23560 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BDNFP23560 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BDNFP23560 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BDNFP23560 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BDNFP23560 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BDNFP23560 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BDNFP23560 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BDNFP23560 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BDNFP23560 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BDNFP23560 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BDNFP23560 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BDNFP23560 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BDNFP23560 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BDNFP23560 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BDNFP23560 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BDNFP23560 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BDNFP23560 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BDNFP23560 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BDNFP23560 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BDNFP23560 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BDNFP23560 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BDNFP23560 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BDNFP23560 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BDNFP23560 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BDNFP23560 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BDNFP23560 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BDNFP23560 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BDNFP23560 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BDNFP23560 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BDNFP23560 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BDNFP23560 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BDNFP23560 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BDNFP23560 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BDNFP23560 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BDNFP23560 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms