Protein–RNA interactions for Protein: P23258

TUBG1, Tubulin gamma-1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBG1P23258 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms