Protein–RNA interactions for Protein: P22314

UBA1, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,058 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA1P22314 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBA1P22314 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBA1P22314 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
UBA1P22314 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBA1P22314 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBA1P22314 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBA1P22314 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBA1P22314 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBA1P22314 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBA1P22314 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBA1P22314 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBA1P22314 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBA1P22314 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBA1P22314 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBA1P22314 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBA1P22314 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBA1P22314 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBA1P22314 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBA1P22314 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBA1P22314 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBA1P22314 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBA1P22314 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBA1P22314 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBA1P22314 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
UBA1P22314 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBA1P22314 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBA1P22314 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBA1P22314 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBA1P22314 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBA1P22314 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBA1P22314 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBA1P22314 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
UBA1P22314 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBA1P22314 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBA1P22314 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBA1P22314 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBA1P22314 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBA1P22314 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBA1P22314 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBA1P22314 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBA1P22314 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBA1P22314 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBA1P22314 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBA1P22314 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBA1P22314 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBA1P22314 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBA1P22314 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBA1P22314 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBA1P22314 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBA1P22314 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBA1P22314 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBA1P22314 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBA1P22314 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBA1P22314 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBA1P22314 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBA1P22314 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBA1P22314 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBA1P22314 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBA1P22314 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBA1P22314 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBA1P22314 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBA1P22314 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBA1P22314 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBA1P22314 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBA1P22314 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
UBA1P22314 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBA1P22314 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBA1P22314 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBA1P22314 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
UBA1P22314 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBA1P22314 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBA1P22314 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBA1P22314 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBA1P22314 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
UBA1P22314 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
UBA1P22314 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBA1P22314 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBA1P22314 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBA1P22314 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBA1P22314 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBA1P22314 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBA1P22314 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBA1P22314 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
UBA1P22314 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBA1P22314 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
UBA1P22314 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBA1P22314 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBA1P22314 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBA1P22314 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
UBA1P22314 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBA1P22314 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBA1P22314 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBA1P22314 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBA1P22314 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBA1P22314 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBA1P22314 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBA1P22314 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
UBA1P22314 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBA1P22314 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBA1P22314 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms