Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDCP20941 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDCP20941 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDCP20941 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDCP20941 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDCP20941 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDCP20941 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PDCP20941 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDCP20941 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDCP20941 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDCP20941 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDCP20941 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDCP20941 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDCP20941 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PDCP20941 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PDCP20941 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDCP20941 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDCP20941 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDCP20941 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PDCP20941 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDCP20941 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PDCP20941 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDCP20941 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDCP20941 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDCP20941 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDCP20941 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDCP20941 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDCP20941 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDCP20941 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDCP20941 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDCP20941 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PDCP20941 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDCP20941 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDCP20941 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDCP20941 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDCP20941 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDCP20941 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDCP20941 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDCP20941 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDCP20941 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDCP20941 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDCP20941 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDCP20941 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDCP20941 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PDCP20941 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDCP20941 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDCP20941 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PDCP20941 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDCP20941 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDCP20941 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDCP20941 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDCP20941 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDCP20941 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDCP20941 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDCP20941 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDCP20941 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDCP20941 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDCP20941 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDCP20941 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDCP20941 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDCP20941 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDCP20941 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDCP20941 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDCP20941 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDCP20941 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDCP20941 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDCP20941 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDCP20941 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PDCP20941 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDCP20941 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDCP20941 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDCP20941 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDCP20941 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDCP20941 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDCP20941 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDCP20941 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDCP20941 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDCP20941 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDCP20941 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDCP20941 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDCP20941 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDCP20941 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDCP20941 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDCP20941 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDCP20941 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDCP20941 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDCP20941 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDCP20941 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDCP20941 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDCP20941 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDCP20941 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDCP20941 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDCP20941 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDCP20941 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDCP20941 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDCP20941 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDCP20941 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDCP20941 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDCP20941 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDCP20941 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms