Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC9A1P19634 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC9A1P19634 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC9A1P19634 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC9A1P19634 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC9A1P19634 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC9A1P19634 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC9A1P19634 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC9A1P19634 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC9A1P19634 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC9A1P19634 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC9A1P19634 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC9A1P19634 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC9A1P19634 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC9A1P19634 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC9A1P19634 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC9A1P19634 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC9A1P19634 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC9A1P19634 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC9A1P19634 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC9A1P19634 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC9A1P19634 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC9A1P19634 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC9A1P19634 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC9A1P19634 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC9A1P19634 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC9A1P19634 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC9A1P19634 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC9A1P19634 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC9A1P19634 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC9A1P19634 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC9A1P19634 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC9A1P19634 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC9A1P19634 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC9A1P19634 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC9A1P19634 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC9A1P19634 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC9A1P19634 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC9A1P19634 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC9A1P19634 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC9A1P19634 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC9A1P19634 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC9A1P19634 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC9A1P19634 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9A1P19634 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9A1P19634 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9A1P19634 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9A1P19634 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9A1P19634 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9A1P19634 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9A1P19634 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9A1P19634 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9A1P19634 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC9A1P19634 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC9A1P19634 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC9A1P19634 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC9A1P19634 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC9A1P19634 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC9A1P19634 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC9A1P19634 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC9A1P19634 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC9A1P19634 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC9A1P19634 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC9A1P19634 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC9A1P19634 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9A1P19634 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9A1P19634 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9A1P19634 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9A1P19634 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9A1P19634 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9A1P19634 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9A1P19634 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9A1P19634 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9A1P19634 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9A1P19634 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9A1P19634 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9A1P19634 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9A1P19634 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9A1P19634 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9A1P19634 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC9A1P19634 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC9A1P19634 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC9A1P19634 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC9A1P19634 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC9A1P19634 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC9A1P19634 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC9A1P19634 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC9A1P19634 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC9A1P19634 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC9A1P19634 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC9A1P19634 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC9A1P19634 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC9A1P19634 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC9A1P19634 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC9A1P19634 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC9A1P19634 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC9A1P19634 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC9A1P19634 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC9A1P19634 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC9A1P19634 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms