Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN1P18031 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN1P18031 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PTPN1P18031 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN1P18031 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN1P18031 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN1P18031 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN1P18031 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN1P18031 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN1P18031 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN1P18031 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN1P18031 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN1P18031 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN1P18031 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN1P18031 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PTPN1P18031 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN1P18031 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN1P18031 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN1P18031 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN1P18031 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN1P18031 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN1P18031 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN1P18031 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN1P18031 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN1P18031 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN1P18031 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN1P18031 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN1P18031 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN1P18031 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN1P18031 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN1P18031 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN1P18031 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN1P18031 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN1P18031 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN1P18031 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN1P18031 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN1P18031 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN1P18031 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN1P18031 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN1P18031 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN1P18031 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN1P18031 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN1P18031 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN1P18031 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN1P18031 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN1P18031 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN1P18031 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN1P18031 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN1P18031 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN1P18031 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN1P18031 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN1P18031 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN1P18031 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN1P18031 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN1P18031 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN1P18031 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN1P18031 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN1P18031 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN1P18031 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN1P18031 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN1P18031 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN1P18031 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN1P18031 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN1P18031 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN1P18031 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN1P18031 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PTPN1P18031 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms