Protein–RNA interactions for Protein: P17900

GM2A, Ganglioside GM2 activator, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GM2AP17900 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GM2AP17900 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GM2AP17900 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GM2AP17900 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GM2AP17900 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GM2AP17900 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GM2AP17900 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GM2AP17900 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GM2AP17900 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GM2AP17900 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GM2AP17900 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GM2AP17900 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GM2AP17900 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GM2AP17900 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GM2AP17900 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GM2AP17900 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GM2AP17900 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GM2AP17900 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GM2AP17900 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GM2AP17900 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GM2AP17900 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GM2AP17900 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GM2AP17900 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GM2AP17900 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GM2AP17900 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GM2AP17900 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GM2AP17900 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GM2AP17900 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GM2AP17900 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GM2AP17900 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GM2AP17900 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GM2AP17900 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GM2AP17900 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GM2AP17900 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GM2AP17900 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GM2AP17900 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GM2AP17900 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GM2AP17900 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GM2AP17900 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GM2AP17900 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GM2AP17900 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GM2AP17900 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GM2AP17900 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GM2AP17900 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GM2AP17900 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GM2AP17900 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GM2AP17900 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GM2AP17900 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GM2AP17900 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GM2AP17900 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GM2AP17900 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GM2AP17900 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GM2AP17900 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GM2AP17900 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GM2AP17900 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GM2AP17900 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GM2AP17900 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GM2AP17900 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GM2AP17900 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GM2AP17900 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GM2AP17900 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GM2AP17900 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GM2AP17900 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GM2AP17900 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GM2AP17900 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GM2AP17900 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GM2AP17900 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GM2AP17900 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GM2AP17900 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GM2AP17900 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GM2AP17900 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GM2AP17900 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GM2AP17900 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GM2AP17900 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GM2AP17900 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GM2AP17900 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GM2AP17900 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GM2AP17900 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GM2AP17900 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GM2AP17900 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GM2AP17900 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GM2AP17900 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GM2AP17900 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GM2AP17900 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GM2AP17900 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GM2AP17900 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GM2AP17900 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GM2AP17900 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GM2AP17900 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GM2AP17900 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GM2AP17900 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GM2AP17900 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GM2AP17900 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GM2AP17900 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GM2AP17900 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GM2AP17900 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GM2AP17900 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GM2AP17900 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GM2AP17900 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GM2AP17900 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms