Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
XBP1P17861 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
XBP1P17861 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
XBP1P17861 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
XBP1P17861 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
XBP1P17861 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
XBP1P17861 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
XBP1P17861 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
XBP1P17861 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
XBP1P17861 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
XBP1P17861 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
XBP1P17861 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
XBP1P17861 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
XBP1P17861 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
XBP1P17861 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
XBP1P17861 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
XBP1P17861 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
XBP1P17861 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
XBP1P17861 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
XBP1P17861 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
XBP1P17861 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
XBP1P17861 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
XBP1P17861 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
XBP1P17861 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
XBP1P17861 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
XBP1P17861 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
XBP1P17861 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
XBP1P17861 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
XBP1P17861 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
XBP1P17861 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
XBP1P17861 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
XBP1P17861 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
XBP1P17861 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
XBP1P17861 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
XBP1P17861 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
XBP1P17861 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
XBP1P17861 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
XBP1P17861 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
XBP1P17861 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
XBP1P17861 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
XBP1P17861 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
XBP1P17861 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
XBP1P17861 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
XBP1P17861 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
XBP1P17861 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
XBP1P17861 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
XBP1P17861 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
XBP1P17861 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
XBP1P17861 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
XBP1P17861 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
XBP1P17861 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
XBP1P17861 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
XBP1P17861 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
XBP1P17861 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
XBP1P17861 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
XBP1P17861 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
XBP1P17861 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
XBP1P17861 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
XBP1P17861 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
XBP1P17861 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
XBP1P17861 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
XBP1P17861 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
XBP1P17861 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
XBP1P17861 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
XBP1P17861 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
XBP1P17861 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
XBP1P17861 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
XBP1P17861 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
XBP1P17861 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
XBP1P17861 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
XBP1P17861 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
XBP1P17861 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
XBP1P17861 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
XBP1P17861 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25■■□□□ 1.59
XBP1P17861 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
XBP1P17861 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
XBP1P17861 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
XBP1P17861 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
XBP1P17861 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
XBP1P17861 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
XBP1P17861 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
XBP1P17861 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
XBP1P17861 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
XBP1P17861 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
XBP1P17861 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
XBP1P17861 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
XBP1P17861 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
XBP1P17861 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
XBP1P17861 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
XBP1P17861 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
XBP1P17861 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
XBP1P17861 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
XBP1P17861 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
XBP1P17861 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
XBP1P17861 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
XBP1P17861 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
XBP1P17861 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
XBP1P17861 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
XBP1P17861 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
XBP1P17861 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms