Protein–RNA interactions for Protein: P17787

CHRNB2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB2P17787 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNB2P17787 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNB2P17787 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNB2P17787 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNB2P17787 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNB2P17787 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNB2P17787 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNB2P17787 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNB2P17787 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNB2P17787 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNB2P17787 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNB2P17787 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNB2P17787 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNB2P17787 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNB2P17787 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNB2P17787 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNB2P17787 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNB2P17787 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNB2P17787 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNB2P17787 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNB2P17787 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNB2P17787 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNB2P17787 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNB2P17787 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNB2P17787 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNB2P17787 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHRNB2P17787 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNB2P17787 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNB2P17787 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNB2P17787 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNB2P17787 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNB2P17787 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNB2P17787 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNB2P17787 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNB2P17787 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNB2P17787 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNB2P17787 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNB2P17787 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNB2P17787 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNB2P17787 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNB2P17787 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNB2P17787 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNB2P17787 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNB2P17787 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNB2P17787 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNB2P17787 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNB2P17787 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNB2P17787 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNB2P17787 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNB2P17787 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNB2P17787 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNB2P17787 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNB2P17787 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNB2P17787 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNB2P17787 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNB2P17787 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNB2P17787 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNB2P17787 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNB2P17787 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNB2P17787 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNB2P17787 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNB2P17787 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNB2P17787 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNB2P17787 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNB2P17787 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNB2P17787 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNB2P17787 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNB2P17787 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNB2P17787 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNB2P17787 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNB2P17787 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNB2P17787 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNB2P17787 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNB2P17787 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNB2P17787 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNB2P17787 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNB2P17787 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNB2P17787 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNB2P17787 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNB2P17787 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNB2P17787 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNB2P17787 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNB2P17787 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNB2P17787 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNB2P17787 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNB2P17787 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNB2P17787 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNB2P17787 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRNB2P17787 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRNB2P17787 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRNB2P17787 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRNB2P17787 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRNB2P17787 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRNB2P17787 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRNB2P17787 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRNB2P17787 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRNB2P17787 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRNB2P17787 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRNB2P17787 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNB2P17787 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms