Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJA1P17302 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJA1P17302 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJA1P17302 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJA1P17302 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJA1P17302 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJA1P17302 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJA1P17302 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJA1P17302 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJA1P17302 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJA1P17302 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJA1P17302 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJA1P17302 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJA1P17302 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJA1P17302 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GJA1P17302 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJA1P17302 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GJA1P17302 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GJA1P17302 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJA1P17302 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJA1P17302 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJA1P17302 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJA1P17302 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJA1P17302 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJA1P17302 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJA1P17302 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJA1P17302 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJA1P17302 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GJA1P17302 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJA1P17302 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJA1P17302 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJA1P17302 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJA1P17302 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJA1P17302 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJA1P17302 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJA1P17302 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJA1P17302 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJA1P17302 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJA1P17302 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GJA1P17302 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJA1P17302 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GJA1P17302 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJA1P17302 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJA1P17302 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJA1P17302 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJA1P17302 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJA1P17302 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJA1P17302 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJA1P17302 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJA1P17302 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJA1P17302 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJA1P17302 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJA1P17302 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJA1P17302 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJA1P17302 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJA1P17302 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJA1P17302 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJA1P17302 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJA1P17302 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJA1P17302 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GJA1P17302 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJA1P17302 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJA1P17302 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJA1P17302 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJA1P17302 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJA1P17302 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GJA1P17302 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJA1P17302 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJA1P17302 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GJA1P17302 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GJA1P17302 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GJA1P17302 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GJA1P17302 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GJA1P17302 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJA1P17302 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJA1P17302 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJA1P17302 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJA1P17302 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJA1P17302 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJA1P17302 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJA1P17302 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJA1P17302 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJA1P17302 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJA1P17302 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJA1P17302 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GJA1P17302 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJA1P17302 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJA1P17302 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJA1P17302 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJA1P17302 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJA1P17302 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GJA1P17302 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJA1P17302 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJA1P17302 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJA1P17302 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJA1P17302 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJA1P17302 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJA1P17302 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJA1P17302 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJA1P17302 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms