Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2A2P16615 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2A2P16615 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2A2P16615 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2A2P16615 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2A2P16615 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2A2P16615 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2A2P16615 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2A2P16615 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2A2P16615 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2A2P16615 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2A2P16615 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2A2P16615 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2A2P16615 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2A2P16615 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2A2P16615 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2A2P16615 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2A2P16615 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2A2P16615 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2A2P16615 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2A2P16615 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2A2P16615 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2A2P16615 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2A2P16615 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2A2P16615 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2A2P16615 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2A2P16615 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP2A2P16615 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP2A2P16615 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP2A2P16615 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP2A2P16615 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP2A2P16615 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP2A2P16615 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP2A2P16615 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP2A2P16615 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP2A2P16615 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP2A2P16615 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP2A2P16615 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP2A2P16615 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP2A2P16615 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP2A2P16615 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP2A2P16615 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP2A2P16615 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP2A2P16615 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP2A2P16615 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP2A2P16615 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP2A2P16615 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP2A2P16615 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP2A2P16615 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP2A2P16615 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP2A2P16615 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP2A2P16615 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP2A2P16615 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP2A2P16615 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP2A2P16615 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP2A2P16615 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP2A2P16615 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP2A2P16615 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP2A2P16615 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP2A2P16615 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP2A2P16615 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP2A2P16615 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP2A2P16615 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2A2P16615 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2A2P16615 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2A2P16615 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2A2P16615 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2A2P16615 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2A2P16615 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2A2P16615 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2A2P16615 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2A2P16615 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2A2P16615 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2A2P16615 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2A2P16615 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2A2P16615 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2A2P16615 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2A2P16615 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2A2P16615 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2A2P16615 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP2A2P16615 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP2A2P16615 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP2A2P16615 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP2A2P16615 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP2A2P16615 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP2A2P16615 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP2A2P16615 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP2A2P16615 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP2A2P16615 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP2A2P16615 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP2A2P16615 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP2A2P16615 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP2A2P16615 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP2A2P16615 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP2A2P16615 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP2A2P16615 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP2A2P16615 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP2A2P16615 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP2A2P16615 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP2A2P16615 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms