Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
EPCAMP16422 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPCAMP16422 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPCAMP16422 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPCAMP16422 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPCAMP16422 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPCAMP16422 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPCAMP16422 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPCAMP16422 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPCAMP16422 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EPCAMP16422 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPCAMP16422 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPCAMP16422 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPCAMP16422 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPCAMP16422 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPCAMP16422 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPCAMP16422 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPCAMP16422 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPCAMP16422 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPCAMP16422 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPCAMP16422 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
EPCAMP16422 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPCAMP16422 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPCAMP16422 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPCAMP16422 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPCAMP16422 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPCAMP16422 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPCAMP16422 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPCAMP16422 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPCAMP16422 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPCAMP16422 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPCAMP16422 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPCAMP16422 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPCAMP16422 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPCAMP16422 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPCAMP16422 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPCAMP16422 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPCAMP16422 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPCAMP16422 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPCAMP16422 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPCAMP16422 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPCAMP16422 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPCAMP16422 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPCAMP16422 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPCAMP16422 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPCAMP16422 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms