Protein–RNA interactions for Protein: P15813

CD1D, Antigen-presenting glycoprotein CD1d, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD1DP15813 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CD1DP15813 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CD1DP15813 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD1DP15813 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CD1DP15813 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD1DP15813 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD1DP15813 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD1DP15813 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CD1DP15813 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD1DP15813 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CD1DP15813 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD1DP15813 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD1DP15813 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CD1DP15813 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CD1DP15813 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD1DP15813 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD1DP15813 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CD1DP15813 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CD1DP15813 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD1DP15813 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD1DP15813 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD1DP15813 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD1DP15813 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD1DP15813 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CD1DP15813 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD1DP15813 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CD1DP15813 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD1DP15813 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD1DP15813 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CD1DP15813 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CD1DP15813 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD1DP15813 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CD1DP15813 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CD1DP15813 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CD1DP15813 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD1DP15813 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CD1DP15813 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CD1DP15813 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CD1DP15813 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD1DP15813 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CD1DP15813 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CD1DP15813 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CD1DP15813 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CD1DP15813 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CD1DP15813 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CD1DP15813 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD1DP15813 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CD1DP15813 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD1DP15813 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD1DP15813 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CD1DP15813 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CD1DP15813 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CD1DP15813 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD1DP15813 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD1DP15813 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CD1DP15813 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD1DP15813 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CD1DP15813 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CD1DP15813 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CD1DP15813 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD1DP15813 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD1DP15813 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CD1DP15813 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CD1DP15813 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CD1DP15813 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD1DP15813 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD1DP15813 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD1DP15813 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD1DP15813 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CD1DP15813 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD1DP15813 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CD1DP15813 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CD1DP15813 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD1DP15813 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD1DP15813 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CD1DP15813 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD1DP15813 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD1DP15813 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CD1DP15813 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD1DP15813 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD1DP15813 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD1DP15813 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD1DP15813 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD1DP15813 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD1DP15813 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD1DP15813 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD1DP15813 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD1DP15813 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD1DP15813 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD1DP15813 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD1DP15813 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD1DP15813 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD1DP15813 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD1DP15813 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD1DP15813 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD1DP15813 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD1DP15813 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD1DP15813 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD1DP15813 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD1DP15813 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms