Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ODC1P11926 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ODC1P11926 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ODC1P11926 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ODC1P11926 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ODC1P11926 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ODC1P11926 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ODC1P11926 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ODC1P11926 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ODC1P11926 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ODC1P11926 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ODC1P11926 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ODC1P11926 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ODC1P11926 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ODC1P11926 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ODC1P11926 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ODC1P11926 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ODC1P11926 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ODC1P11926 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ODC1P11926 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ODC1P11926 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ODC1P11926 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ODC1P11926 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ODC1P11926 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ODC1P11926 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ODC1P11926 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ODC1P11926 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ODC1P11926 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ODC1P11926 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ODC1P11926 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ODC1P11926 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ODC1P11926 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
ODC1P11926 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ODC1P11926 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ODC1P11926 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ODC1P11926 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ODC1P11926 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ODC1P11926 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ODC1P11926 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ODC1P11926 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ODC1P11926 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ODC1P11926 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ODC1P11926 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ODC1P11926 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ODC1P11926 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ODC1P11926 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ODC1P11926 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ODC1P11926 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ODC1P11926 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ODC1P11926 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ODC1P11926 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ODC1P11926 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ODC1P11926 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ODC1P11926 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ODC1P11926 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ODC1P11926 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ODC1P11926 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ODC1P11926 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ODC1P11926 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ODC1P11926 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ODC1P11926 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ODC1P11926 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ODC1P11926 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ODC1P11926 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ODC1P11926 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ODC1P11926 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ODC1P11926 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ODC1P11926 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ODC1P11926 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ODC1P11926 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ODC1P11926 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ODC1P11926 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ODC1P11926 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ODC1P11926 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ODC1P11926 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ODC1P11926 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ODC1P11926 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ODC1P11926 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ODC1P11926 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ODC1P11926 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ODC1P11926 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ODC1P11926 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ODC1P11926 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ODC1P11926 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ODC1P11926 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ODC1P11926 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ODC1P11926 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ODC1P11926 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ODC1P11926 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ODC1P11926 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ODC1P11926 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ODC1P11926 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ODC1P11926 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ODC1P11926 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ODC1P11926 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ODC1P11926 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ODC1P11926 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ODC1P11926 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ODC1P11926 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ODC1P11926 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms