Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MS4A1P11836 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MS4A1P11836 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MS4A1P11836 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MS4A1P11836 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
MS4A1P11836 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MS4A1P11836 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MS4A1P11836 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MS4A1P11836 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MS4A1P11836 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MS4A1P11836 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MS4A1P11836 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MS4A1P11836 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MS4A1P11836 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MS4A1P11836 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
MS4A1P11836 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MS4A1P11836 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MS4A1P11836 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MS4A1P11836 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MS4A1P11836 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
MS4A1P11836 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MS4A1P11836 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MS4A1P11836 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MS4A1P11836 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MS4A1P11836 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MS4A1P11836 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MS4A1P11836 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MS4A1P11836 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MS4A1P11836 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MS4A1P11836 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MS4A1P11836 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MS4A1P11836 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MS4A1P11836 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MS4A1P11836 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MS4A1P11836 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MS4A1P11836 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MS4A1P11836 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MS4A1P11836 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
MS4A1P11836 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MS4A1P11836 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MS4A1P11836 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
MS4A1P11836 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MS4A1P11836 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MS4A1P11836 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MS4A1P11836 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MS4A1P11836 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MS4A1P11836 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MS4A1P11836 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MS4A1P11836 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MS4A1P11836 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MS4A1P11836 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MS4A1P11836 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MS4A1P11836 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MS4A1P11836 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MS4A1P11836 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MS4A1P11836 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MS4A1P11836 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MS4A1P11836 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MS4A1P11836 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MS4A1P11836 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MS4A1P11836 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MS4A1P11836 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MS4A1P11836 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MS4A1P11836 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MS4A1P11836 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MS4A1P11836 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MS4A1P11836 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MS4A1P11836 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MS4A1P11836 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MS4A1P11836 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MS4A1P11836 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MS4A1P11836 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MS4A1P11836 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MS4A1P11836 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MS4A1P11836 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MS4A1P11836 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MS4A1P11836 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
MS4A1P11836 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MS4A1P11836 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MS4A1P11836 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MS4A1P11836 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MS4A1P11836 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MS4A1P11836 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MS4A1P11836 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MS4A1P11836 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MS4A1P11836 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MS4A1P11836 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MS4A1P11836 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MS4A1P11836 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MS4A1P11836 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MS4A1P11836 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
MS4A1P11836 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
MS4A1P11836 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
MS4A1P11836 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
MS4A1P11836 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
MS4A1P11836 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MS4A1P11836 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MS4A1P11836 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MS4A1P11836 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MS4A1P11836 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms