Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP2C9P11712 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP2C9P11712 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP2C9P11712 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP2C9P11712 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP2C9P11712 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP2C9P11712 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP2C9P11712 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP2C9P11712 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP2C9P11712 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP2C9P11712 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP2C9P11712 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP2C9P11712 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP2C9P11712 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP2C9P11712 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYP2C9P11712 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYP2C9P11712 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYP2C9P11712 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYP2C9P11712 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYP2C9P11712 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYP2C9P11712 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYP2C9P11712 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYP2C9P11712 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYP2C9P11712 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYP2C9P11712 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYP2C9P11712 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYP2C9P11712 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYP2C9P11712 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYP2C9P11712 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYP2C9P11712 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYP2C9P11712 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYP2C9P11712 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYP2C9P11712 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYP2C9P11712 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYP2C9P11712 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYP2C9P11712 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYP2C9P11712 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP2C9P11712 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP2C9P11712 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP2C9P11712 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP2C9P11712 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP2C9P11712 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP2C9P11712 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP2C9P11712 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP2C9P11712 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP2C9P11712 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP2C9P11712 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP2C9P11712 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP2C9P11712 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP2C9P11712 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYP2C9P11712 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYP2C9P11712 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYP2C9P11712 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYP2C9P11712 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYP2C9P11712 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYP2C9P11712 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYP2C9P11712 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYP2C9P11712 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYP2C9P11712 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYP2C9P11712 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYP2C9P11712 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYP2C9P11712 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYP2C9P11712 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYP2C9P11712 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYP2C9P11712 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYP2C9P11712 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYP2C9P11712 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYP2C9P11712 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYP2C9P11712 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYP2C9P11712 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYP2C9P11712 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYP2C9P11712 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYP2C9P11712 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYP2C9P11712 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYP2C9P11712 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYP2C9P11712 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CYP2C9P11712 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYP2C9P11712 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP2C9P11712 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP2C9P11712 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP2C9P11712 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP2C9P11712 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP2C9P11712 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP2C9P11712 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP2C9P11712 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP2C9P11712 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP2C9P11712 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP2C9P11712 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP2C9P11712 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP2C9P11712 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP2C9P11712 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP2C9P11712 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP2C9P11712 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP2C9P11712 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP2C9P11712 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYP2C9P11712 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYP2C9P11712 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYP2C9P11712 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYP2C9P11712 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYP2C9P11712 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms