Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC38.53■■■■□ 3.76
TOP2AP11388 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
TOP2AP11388 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
TOP2AP11388 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
TOP2AP11388 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
TOP2AP11388 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
TOP2AP11388 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
TOP2AP11388 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
TOP2AP11388 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
TOP2AP11388 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
TOP2AP11388 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC38.52■■■■□ 3.76
TOP2AP11388 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
TOP2AP11388 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC38.52■■■■□ 3.76
TOP2AP11388 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
TOP2AP11388 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
TOP2AP11388 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
TOP2AP11388 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC38.51■■■■□ 3.76
TOP2AP11388 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
TOP2AP11388 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75
TOP2AP11388 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC38.5■■■■□ 3.75
TOP2AP11388 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
TOP2AP11388 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
TOP2AP11388 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
TOP2AP11388 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
TOP2AP11388 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
TOP2AP11388 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
TOP2AP11388 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
TOP2AP11388 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
TOP2AP11388 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC38.48■■■■□ 3.75
TOP2AP11388 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
TOP2AP11388 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
TOP2AP11388 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
TOP2AP11388 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
TOP2AP11388 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
TOP2AP11388 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
TOP2AP11388 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC38.48■■■■□ 3.75
TOP2AP11388 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC38.48■■■■□ 3.75
TOP2AP11388 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC38.48■■■■□ 3.75
TOP2AP11388 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
TOP2AP11388 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
TOP2AP11388 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
TOP2AP11388 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
TOP2AP11388 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
TOP2AP11388 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC38.47■■■■□ 3.75
TOP2AP11388 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
TOP2AP11388 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
TOP2AP11388 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
TOP2AP11388 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
TOP2AP11388 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
TOP2AP11388 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
TOP2AP11388 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC38.46■■■■□ 3.75
TOP2AP11388 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
TOP2AP11388 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
TOP2AP11388 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
TOP2AP11388 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
TOP2AP11388 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
TOP2AP11388 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
TOP2AP11388 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
TOP2AP11388 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
TOP2AP11388 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
TOP2AP11388 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
TOP2AP11388 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
TOP2AP11388 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC38.45■■■■□ 3.75
TOP2AP11388 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
TOP2AP11388 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.45■■■■□ 3.75
TOP2AP11388 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
TOP2AP11388 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
TOP2AP11388 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
TOP2AP11388 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
TOP2AP11388 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
TOP2AP11388 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
TOP2AP11388 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.44■■■■□ 3.74
TOP2AP11388 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
TOP2AP11388 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
TOP2AP11388 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
TOP2AP11388 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
TOP2AP11388 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
TOP2AP11388 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
TOP2AP11388 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
TOP2AP11388 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
TOP2AP11388 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
TOP2AP11388 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC38.43■■■■□ 3.74
TOP2AP11388 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC38.42■■■■□ 3.74
TOP2AP11388 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
TOP2AP11388 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
TOP2AP11388 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
TOP2AP11388 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
TOP2AP11388 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
TOP2AP11388 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
TOP2AP11388 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
TOP2AP11388 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
TOP2AP11388 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
TOP2AP11388 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC38.41■■■■□ 3.74
TOP2AP11388 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
TOP2AP11388 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
TOP2AP11388 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
TOP2AP11388 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
TOP2AP11388 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
TOP2AP11388 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC38.4■■■■□ 3.74
TOP2AP11388 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 196.6 ms