Protein–RNA interactions for Protein: P11229

CHRM1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRM1P11229 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRM1P11229 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms