Protein–RNA interactions for Protein: P10276

RARA, Retinoic acid receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARAP10276 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RARAP10276 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RARAP10276 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RARAP10276 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RARAP10276 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RARAP10276 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RARAP10276 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RARAP10276 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RARAP10276 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RARAP10276 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RARAP10276 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RARAP10276 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RARAP10276 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RARAP10276 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RARAP10276 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RARAP10276 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RARAP10276 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RARAP10276 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RARAP10276 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RARAP10276 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RARAP10276 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RARAP10276 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RARAP10276 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RARAP10276 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RARAP10276 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RARAP10276 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RARAP10276 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RARAP10276 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RARAP10276 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RARAP10276 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RARAP10276 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RARAP10276 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RARAP10276 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RARAP10276 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RARAP10276 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RARAP10276 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RARAP10276 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RARAP10276 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RARAP10276 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RARAP10276 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RARAP10276 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RARAP10276 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RARAP10276 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RARAP10276 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RARAP10276 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RARAP10276 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RARAP10276 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RARAP10276 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RARAP10276 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RARAP10276 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RARAP10276 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RARAP10276 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RARAP10276 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RARAP10276 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RARAP10276 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RARAP10276 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RARAP10276 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RARAP10276 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RARAP10276 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RARAP10276 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RARAP10276 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RARAP10276 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RARAP10276 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RARAP10276 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RARAP10276 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RARAP10276 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RARAP10276 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RARAP10276 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RARAP10276 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RARAP10276 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RARAP10276 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RARAP10276 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RARAP10276 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RARAP10276 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RARAP10276 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RARAP10276 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RARAP10276 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RARAP10276 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RARAP10276 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RARAP10276 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
RARAP10276 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RARAP10276 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RARAP10276 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RARAP10276 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RARAP10276 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RARAP10276 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RARAP10276 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RARAP10276 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RARAP10276 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RARAP10276 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RARAP10276 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RARAP10276 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RARAP10276 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RARAP10276 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RARAP10276 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RARAP10276 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RARAP10276 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RARAP10276 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RARAP10276 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RARAP10276 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms