Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C8orf88P0DMB2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C8orf88P0DMB2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C8orf88P0DMB2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C8orf88P0DMB2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C8orf88P0DMB2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C8orf88P0DMB2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C8orf88P0DMB2 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C8orf88P0DMB2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C8orf88P0DMB2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C8orf88P0DMB2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C8orf88P0DMB2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C8orf88P0DMB2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C8orf88P0DMB2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
C8orf88P0DMB2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
C8orf88P0DMB2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C8orf88P0DMB2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
C8orf88P0DMB2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C8orf88P0DMB2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
C8orf88P0DMB2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms