Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CT47B1P0C2W7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CT47B1P0C2W7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CT47B1P0C2W7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CT47B1P0C2W7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CT47B1P0C2W7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CT47B1P0C2W7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CT47B1P0C2W7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CT47B1P0C2W7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CT47B1P0C2W7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CT47B1P0C2W7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CT47B1P0C2W7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CT47B1P0C2W7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CT47B1P0C2W7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CT47B1P0C2W7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CT47B1P0C2W7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CT47B1P0C2W7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CT47B1P0C2W7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CT47B1P0C2W7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CT47B1P0C2W7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CT47B1P0C2W7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CT47B1P0C2W7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CT47B1P0C2W7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CT47B1P0C2W7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CT47B1P0C2W7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CT47B1P0C2W7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CT47B1P0C2W7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CT47B1P0C2W7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CT47B1P0C2W7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CT47B1P0C2W7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CT47B1P0C2W7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CT47B1P0C2W7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CT47B1P0C2W7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CT47B1P0C2W7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CT47B1P0C2W7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CT47B1P0C2W7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CT47B1P0C2W7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CT47B1P0C2W7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CT47B1P0C2W7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CT47B1P0C2W7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CT47B1P0C2W7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CT47B1P0C2W7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CT47B1P0C2W7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CT47B1P0C2W7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CT47B1P0C2W7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CT47B1P0C2W7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CT47B1P0C2W7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CT47B1P0C2W7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CT47B1P0C2W7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CT47B1P0C2W7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CT47B1P0C2W7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CT47B1P0C2W7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CT47B1P0C2W7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CT47B1P0C2W7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CT47B1P0C2W7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CT47B1P0C2W7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CT47B1P0C2W7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CT47B1P0C2W7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CT47B1P0C2W7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CT47B1P0C2W7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CT47B1P0C2W7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CT47B1P0C2W7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CT47B1P0C2W7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CT47B1P0C2W7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CT47B1P0C2W7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CT47B1P0C2W7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CT47B1P0C2W7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CT47B1P0C2W7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CT47B1P0C2W7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CT47B1P0C2W7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CT47B1P0C2W7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CT47B1P0C2W7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CT47B1P0C2W7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CT47B1P0C2W7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CT47B1P0C2W7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CT47B1P0C2W7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CT47B1P0C2W7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CT47B1P0C2W7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CT47B1P0C2W7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CT47B1P0C2W7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CT47B1P0C2W7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CT47B1P0C2W7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CT47B1P0C2W7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CT47B1P0C2W7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CT47B1P0C2W7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CT47B1P0C2W7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CT47B1P0C2W7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CT47B1P0C2W7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CT47B1P0C2W7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CT47B1P0C2W7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CT47B1P0C2W7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CT47B1P0C2W7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CT47B1P0C2W7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CT47B1P0C2W7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CT47B1P0C2W7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CT47B1P0C2W7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CT47B1P0C2W7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CT47B1P0C2W7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CT47B1P0C2W7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CT47B1P0C2W7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms