Protein–RNA interactions for Protein: P08729

KRT7, Keratin, type II cytoskeletal 7, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT7P08729 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT7P08729 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT7P08729 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT7P08729 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT7P08729 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT7P08729 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT7P08729 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT7P08729 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT7P08729 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT7P08729 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT7P08729 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT7P08729 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT7P08729 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT7P08729 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT7P08729 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT7P08729 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT7P08729 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT7P08729 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT7P08729 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT7P08729 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT7P08729 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT7P08729 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT7P08729 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT7P08729 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT7P08729 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT7P08729 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT7P08729 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT7P08729 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT7P08729 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT7P08729 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT7P08729 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT7P08729 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT7P08729 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT7P08729 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT7P08729 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT7P08729 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT7P08729 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT7P08729 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT7P08729 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT7P08729 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT7P08729 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT7P08729 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT7P08729 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT7P08729 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT7P08729 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT7P08729 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT7P08729 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT7P08729 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT7P08729 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT7P08729 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT7P08729 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT7P08729 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT7P08729 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT7P08729 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT7P08729 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT7P08729 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT7P08729 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT7P08729 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT7P08729 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT7P08729 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT7P08729 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT7P08729 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT7P08729 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT7P08729 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
KRT7P08729 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KRT7P08729 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT7P08729 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT7P08729 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT7P08729 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT7P08729 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT7P08729 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT7P08729 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT7P08729 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT7P08729 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT7P08729 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT7P08729 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT7P08729 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT7P08729 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT7P08729 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT7P08729 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT7P08729 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT7P08729 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT7P08729 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT7P08729 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT7P08729 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT7P08729 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT7P08729 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT7P08729 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT7P08729 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT7P08729 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT7P08729 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT7P08729 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT7P08729 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT7P08729 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT7P08729 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT7P08729 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT7P08729 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT7P08729 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT7P08729 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT7P08729 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms