Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GLI1P08151 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GLI1P08151 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GLI1P08151 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GLI1P08151 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GLI1P08151 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GLI1P08151 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GLI1P08151 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GLI1P08151 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GLI1P08151 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GLI1P08151 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GLI1P08151 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GLI1P08151 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GLI1P08151 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GLI1P08151 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GLI1P08151 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GLI1P08151 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GLI1P08151 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GLI1P08151 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GLI1P08151 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GLI1P08151 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GLI1P08151 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GLI1P08151 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
GLI1P08151 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GLI1P08151 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GLI1P08151 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GLI1P08151 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GLI1P08151 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GLI1P08151 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GLI1P08151 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GLI1P08151 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GLI1P08151 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GLI1P08151 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GLI1P08151 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GLI1P08151 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GLI1P08151 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GLI1P08151 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GLI1P08151 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GLI1P08151 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GLI1P08151 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GLI1P08151 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GLI1P08151 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GLI1P08151 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GLI1P08151 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GLI1P08151 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GLI1P08151 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GLI1P08151 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GLI1P08151 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GLI1P08151 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GLI1P08151 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GLI1P08151 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GLI1P08151 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GLI1P08151 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GLI1P08151 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GLI1P08151 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GLI1P08151 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GLI1P08151 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GLI1P08151 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GLI1P08151 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GLI1P08151 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GLI1P08151 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GLI1P08151 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GLI1P08151 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GLI1P08151 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GLI1P08151 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GLI1P08151 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GLI1P08151 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GLI1P08151 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GLI1P08151 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GLI1P08151 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GLI1P08151 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GLI1P08151 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GLI1P08151 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GLI1P08151 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GLI1P08151 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GLI1P08151 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GLI1P08151 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GLI1P08151 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GLI1P08151 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GLI1P08151 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GLI1P08151 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GLI1P08151 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GLI1P08151 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GLI1P08151 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GLI1P08151 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GLI1P08151 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GLI1P08151 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GLI1P08151 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GLI1P08151 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GLI1P08151 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GLI1P08151 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GLI1P08151 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GLI1P08151 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GLI1P08151 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GLI1P08151 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GLI1P08151 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLI1P08151 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLI1P08151 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLI1P08151 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLI1P08151 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms