Protein–RNA interactions for Protein: P07195

LDHB, L-lactate dehydrogenase B chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHBP07195 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LDHBP07195 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LDHBP07195 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LDHBP07195 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LDHBP07195 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LDHBP07195 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LDHBP07195 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LDHBP07195 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LDHBP07195 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LDHBP07195 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LDHBP07195 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LDHBP07195 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LDHBP07195 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LDHBP07195 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LDHBP07195 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LDHBP07195 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LDHBP07195 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LDHBP07195 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LDHBP07195 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LDHBP07195 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LDHBP07195 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LDHBP07195 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LDHBP07195 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LDHBP07195 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LDHBP07195 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LDHBP07195 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LDHBP07195 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LDHBP07195 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LDHBP07195 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LDHBP07195 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
LDHBP07195 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LDHBP07195 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LDHBP07195 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LDHBP07195 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LDHBP07195 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LDHBP07195 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LDHBP07195 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LDHBP07195 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LDHBP07195 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LDHBP07195 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LDHBP07195 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LDHBP07195 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LDHBP07195 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LDHBP07195 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LDHBP07195 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LDHBP07195 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LDHBP07195 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LDHBP07195 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LDHBP07195 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LDHBP07195 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LDHBP07195 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
LDHBP07195 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
LDHBP07195 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LDHBP07195 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LDHBP07195 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LDHBP07195 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LDHBP07195 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LDHBP07195 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
LDHBP07195 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LDHBP07195 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LDHBP07195 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LDHBP07195 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LDHBP07195 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LDHBP07195 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LDHBP07195 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LDHBP07195 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LDHBP07195 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LDHBP07195 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LDHBP07195 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LDHBP07195 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LDHBP07195 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LDHBP07195 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
LDHBP07195 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LDHBP07195 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
LDHBP07195 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LDHBP07195 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LDHBP07195 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LDHBP07195 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LDHBP07195 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LDHBP07195 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LDHBP07195 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
LDHBP07195 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LDHBP07195 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LDHBP07195 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LDHBP07195 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LDHBP07195 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
LDHBP07195 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LDHBP07195 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LDHBP07195 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LDHBP07195 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LDHBP07195 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LDHBP07195 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
LDHBP07195 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LDHBP07195 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
LDHBP07195 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
LDHBP07195 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
LDHBP07195 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LDHBP07195 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
LDHBP07195 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LDHBP07195 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms