Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGAVP06756 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGAVP06756 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGAVP06756 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGAVP06756 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGAVP06756 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGAVP06756 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGAVP06756 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGAVP06756 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGAVP06756 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGAVP06756 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGAVP06756 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGAVP06756 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGAVP06756 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGAVP06756 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGAVP06756 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGAVP06756 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGAVP06756 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGAVP06756 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGAVP06756 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGAVP06756 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGAVP06756 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGAVP06756 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGAVP06756 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGAVP06756 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGAVP06756 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGAVP06756 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGAVP06756 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGAVP06756 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGAVP06756 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGAVP06756 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGAVP06756 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGAVP06756 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGAVP06756 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGAVP06756 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGAVP06756 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGAVP06756 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGAVP06756 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGAVP06756 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGAVP06756 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGAVP06756 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGAVP06756 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGAVP06756 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGAVP06756 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGAVP06756 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGAVP06756 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGAVP06756 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGAVP06756 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGAVP06756 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGAVP06756 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGAVP06756 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGAVP06756 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGAVP06756 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGAVP06756 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGAVP06756 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGAVP06756 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGAVP06756 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGAVP06756 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGAVP06756 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGAVP06756 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGAVP06756 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGAVP06756 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGAVP06756 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGAVP06756 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGAVP06756 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGAVP06756 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGAVP06756 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGAVP06756 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGAVP06756 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGAVP06756 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGAVP06756 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGAVP06756 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGAVP06756 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGAVP06756 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGAVP06756 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGAVP06756 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGAVP06756 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGAVP06756 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGAVP06756 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGAVP06756 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGAVP06756 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGAVP06756 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGAVP06756 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGAVP06756 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGAVP06756 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGAVP06756 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGAVP06756 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGAVP06756 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGAVP06756 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGAVP06756 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGAVP06756 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGAVP06756 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGAVP06756 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGAVP06756 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGAVP06756 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGAVP06756 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ITGAVP06756 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGAVP06756 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGAVP06756 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGAVP06756 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms