Protein–RNA interactions for Protein: P02649

APOE, Apolipoprotein E, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOEP02649 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOEP02649 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOEP02649 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOEP02649 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOEP02649 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOEP02649 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOEP02649 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOEP02649 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOEP02649 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOEP02649 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOEP02649 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOEP02649 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOEP02649 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOEP02649 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOEP02649 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOEP02649 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
APOEP02649 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOEP02649 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOEP02649 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOEP02649 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOEP02649 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
APOEP02649 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
APOEP02649 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
APOEP02649 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOEP02649 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOEP02649 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOEP02649 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOEP02649 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOEP02649 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOEP02649 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOEP02649 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOEP02649 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOEP02649 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOEP02649 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOEP02649 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOEP02649 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOEP02649 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOEP02649 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOEP02649 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOEP02649 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOEP02649 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOEP02649 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOEP02649 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOEP02649 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOEP02649 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOEP02649 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOEP02649 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOEP02649 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOEP02649 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOEP02649 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOEP02649 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOEP02649 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
APOEP02649 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOEP02649 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOEP02649 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOEP02649 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOEP02649 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOEP02649 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOEP02649 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOEP02649 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOEP02649 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOEP02649 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOEP02649 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOEP02649 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOEP02649 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOEP02649 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOEP02649 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOEP02649 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
APOEP02649 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOEP02649 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOEP02649 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOEP02649 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOEP02649 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOEP02649 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOEP02649 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOEP02649 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOEP02649 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
APOEP02649 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOEP02649 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOEP02649 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOEP02649 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOEP02649 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOEP02649 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOEP02649 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOEP02649 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOEP02649 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOEP02649 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOEP02649 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOEP02649 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOEP02649 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOEP02649 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOEP02649 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOEP02649 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOEP02649 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOEP02649 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOEP02649 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOEP02649 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOEP02649 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOEP02649 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOEP02649 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms