Protein–RNA interactions for Protein: P02585

TNNC2, Troponin C, skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNC2P02585 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNC2P02585 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNC2P02585 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNC2P02585 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNC2P02585 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNC2P02585 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNC2P02585 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNC2P02585 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNC2P02585 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNC2P02585 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNC2P02585 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNC2P02585 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNC2P02585 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNC2P02585 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNC2P02585 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNC2P02585 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNC2P02585 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNC2P02585 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNC2P02585 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNC2P02585 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNC2P02585 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNC2P02585 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNC2P02585 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNC2P02585 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNC2P02585 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNC2P02585 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNC2P02585 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNC2P02585 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNC2P02585 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNC2P02585 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNC2P02585 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNC2P02585 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNC2P02585 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNC2P02585 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNC2P02585 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNC2P02585 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNC2P02585 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNC2P02585 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNC2P02585 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNC2P02585 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNC2P02585 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNC2P02585 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNC2P02585 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNC2P02585 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNC2P02585 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNC2P02585 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNC2P02585 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNC2P02585 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNC2P02585 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNC2P02585 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNC2P02585 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNC2P02585 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNC2P02585 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNC2P02585 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNC2P02585 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNC2P02585 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNC2P02585 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNC2P02585 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNC2P02585 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNC2P02585 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNC2P02585 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNC2P02585 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNC2P02585 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNC2P02585 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNC2P02585 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNC2P02585 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNC2P02585 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNC2P02585 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNC2P02585 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNC2P02585 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNC2P02585 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNC2P02585 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNC2P02585 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms