Protein–RNA interactions for Protein: P01133

EGF, Pro-epidermal growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFP01133 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EGFP01133 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EGFP01133 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EGFP01133 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EGFP01133 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EGFP01133 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EGFP01133 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EGFP01133 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EGFP01133 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EGFP01133 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EGFP01133 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EGFP01133 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EGFP01133 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EGFP01133 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EGFP01133 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EGFP01133 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EGFP01133 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EGFP01133 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EGFP01133 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EGFP01133 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EGFP01133 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EGFP01133 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EGFP01133 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EGFP01133 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EGFP01133 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EGFP01133 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EGFP01133 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EGFP01133 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EGFP01133 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EGFP01133 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EGFP01133 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EGFP01133 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EGFP01133 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EGFP01133 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EGFP01133 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EGFP01133 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EGFP01133 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EGFP01133 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
EGFP01133 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EGFP01133 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EGFP01133 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EGFP01133 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EGFP01133 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EGFP01133 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EGFP01133 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EGFP01133 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EGFP01133 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EGFP01133 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EGFP01133 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EGFP01133 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EGFP01133 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EGFP01133 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
EGFP01133 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EGFP01133 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EGFP01133 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EGFP01133 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EGFP01133 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EGFP01133 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EGFP01133 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EGFP01133 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EGFP01133 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EGFP01133 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EGFP01133 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EGFP01133 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EGFP01133 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EGFP01133 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22■■□□□ 1.11
EGFP01133 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EGFP01133 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
EGFP01133 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EGFP01133 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22■■□□□ 1.11
EGFP01133 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EGFP01133 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EGFP01133 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EGFP01133 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EGFP01133 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
EGFP01133 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EGFP01133 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EGFP01133 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EGFP01133 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EGFP01133 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
EGFP01133 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EGFP01133 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EGFP01133 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EGFP01133 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EGFP01133 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
EGFP01133 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EGFP01133 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EGFP01133 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EGFP01133 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EGFP01133 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EGFP01133 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EGFP01133 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EGFP01133 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EGFP01133 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EGFP01133 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
EGFP01133 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
EGFP01133 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
EGFP01133 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EGFP01133 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EGFP01133 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms