Protein–RNA interactions for Protein: P00740

F9, Coagulation factor IX, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F9P00740 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
F9P00740 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
F9P00740 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
F9P00740 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
F9P00740 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
F9P00740 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
F9P00740 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
F9P00740 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
F9P00740 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
F9P00740 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
F9P00740 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
F9P00740 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
F9P00740 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
F9P00740 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
F9P00740 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
F9P00740 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
F9P00740 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
F9P00740 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
F9P00740 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
F9P00740 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
F9P00740 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
F9P00740 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
F9P00740 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
F9P00740 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
F9P00740 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
F9P00740 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
F9P00740 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
F9P00740 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
F9P00740 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
F9P00740 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
F9P00740 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
F9P00740 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
F9P00740 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
F9P00740 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
F9P00740 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
F9P00740 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
F9P00740 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
F9P00740 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
F9P00740 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
F9P00740 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
F9P00740 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
F9P00740 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
F9P00740 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
F9P00740 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
F9P00740 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
F9P00740 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
F9P00740 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
F9P00740 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
F9P00740 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
F9P00740 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
F9P00740 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
F9P00740 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
F9P00740 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
F9P00740 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
F9P00740 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
F9P00740 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
F9P00740 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
F9P00740 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
F9P00740 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
F9P00740 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
F9P00740 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
F9P00740 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
F9P00740 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
F9P00740 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
F9P00740 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
F9P00740 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
F9P00740 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
F9P00740 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
F9P00740 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
F9P00740 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
F9P00740 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
F9P00740 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
F9P00740 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
F9P00740 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
F9P00740 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
F9P00740 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
F9P00740 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
F9P00740 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
F9P00740 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
F9P00740 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
F9P00740 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
F9P00740 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
F9P00740 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
F9P00740 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
F9P00740 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
F9P00740 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
F9P00740 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
F9P00740 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
F9P00740 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
F9P00740 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
F9P00740 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
F9P00740 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
F9P00740 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
F9P00740 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
F9P00740 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
F9P00740 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
F9P00740 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
F9P00740 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
F9P00740 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
F9P00740 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms