Protein–RNA interactions for Protein: O95900

TRUB2, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase TRUB2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRUB2O95900 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TRUB2O95900 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TRUB2O95900 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRUB2O95900 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRUB2O95900 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRUB2O95900 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRUB2O95900 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRUB2O95900 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRUB2O95900 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRUB2O95900 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRUB2O95900 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRUB2O95900 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRUB2O95900 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRUB2O95900 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRUB2O95900 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRUB2O95900 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRUB2O95900 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRUB2O95900 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRUB2O95900 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRUB2O95900 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRUB2O95900 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRUB2O95900 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRUB2O95900 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRUB2O95900 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRUB2O95900 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRUB2O95900 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRUB2O95900 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRUB2O95900 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRUB2O95900 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRUB2O95900 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRUB2O95900 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRUB2O95900 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRUB2O95900 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRUB2O95900 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRUB2O95900 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRUB2O95900 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRUB2O95900 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRUB2O95900 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRUB2O95900 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRUB2O95900 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRUB2O95900 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRUB2O95900 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRUB2O95900 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRUB2O95900 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRUB2O95900 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRUB2O95900 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRUB2O95900 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRUB2O95900 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRUB2O95900 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRUB2O95900 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRUB2O95900 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRUB2O95900 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRUB2O95900 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRUB2O95900 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRUB2O95900 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRUB2O95900 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRUB2O95900 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRUB2O95900 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRUB2O95900 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRUB2O95900 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRUB2O95900 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRUB2O95900 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRUB2O95900 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRUB2O95900 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRUB2O95900 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRUB2O95900 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRUB2O95900 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRUB2O95900 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRUB2O95900 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRUB2O95900 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRUB2O95900 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRUB2O95900 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRUB2O95900 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRUB2O95900 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms