Protein–RNA interactions for Protein: O95347

SMC2, Structural maintenance of chromosomes protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC2O95347 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMC2O95347 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMC2O95347 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMC2O95347 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMC2O95347 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMC2O95347 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMC2O95347 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMC2O95347 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMC2O95347 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMC2O95347 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMC2O95347 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMC2O95347 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMC2O95347 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMC2O95347 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMC2O95347 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMC2O95347 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMC2O95347 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMC2O95347 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMC2O95347 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMC2O95347 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMC2O95347 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMC2O95347 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMC2O95347 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMC2O95347 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMC2O95347 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMC2O95347 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SMC2O95347 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMC2O95347 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SMC2O95347 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMC2O95347 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMC2O95347 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMC2O95347 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMC2O95347 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMC2O95347 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMC2O95347 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMC2O95347 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMC2O95347 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMC2O95347 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMC2O95347 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMC2O95347 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMC2O95347 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMC2O95347 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMC2O95347 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMC2O95347 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMC2O95347 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMC2O95347 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMC2O95347 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMC2O95347 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMC2O95347 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMC2O95347 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMC2O95347 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMC2O95347 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMC2O95347 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMC2O95347 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMC2O95347 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMC2O95347 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMC2O95347 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMC2O95347 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMC2O95347 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMC2O95347 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMC2O95347 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMC2O95347 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMC2O95347 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMC2O95347 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMC2O95347 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMC2O95347 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMC2O95347 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMC2O95347 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMC2O95347 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMC2O95347 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMC2O95347 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMC2O95347 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMC2O95347 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMC2O95347 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMC2O95347 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMC2O95347 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMC2O95347 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMC2O95347 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMC2O95347 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMC2O95347 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMC2O95347 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMC2O95347 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SMC2O95347 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMC2O95347 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMC2O95347 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMC2O95347 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMC2O95347 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMC2O95347 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMC2O95347 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMC2O95347 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMC2O95347 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMC2O95347 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMC2O95347 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMC2O95347 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMC2O95347 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMC2O95347 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMC2O95347 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMC2O95347 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMC2O95347 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMC2O95347 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms