Protein–RNA interactions for Protein: O94906

PRPF6, Pre-mRNA-processing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF6O94906 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF6O94906 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF6O94906 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF6O94906 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF6O94906 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF6O94906 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF6O94906 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF6O94906 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms