Protein–RNA interactions for Protein: O94779

CNTN5, Contactin-5, humanhuman

Predictions only

Length 1,100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN5O94779 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN5O94779 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN5O94779 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN5O94779 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN5O94779 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN5O94779 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN5O94779 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN5O94779 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN5O94779 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN5O94779 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN5O94779 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN5O94779 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN5O94779 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN5O94779 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN5O94779 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN5O94779 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN5O94779 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN5O94779 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN5O94779 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN5O94779 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN5O94779 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN5O94779 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN5O94779 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN5O94779 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN5O94779 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN5O94779 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN5O94779 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN5O94779 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN5O94779 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN5O94779 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN5O94779 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN5O94779 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN5O94779 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN5O94779 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN5O94779 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTN5O94779 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTN5O94779 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTN5O94779 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTN5O94779 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTN5O94779 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTN5O94779 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTN5O94779 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTN5O94779 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTN5O94779 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTN5O94779 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms