Protein–RNA interactions for Protein: O75386

TULP3, Tubby-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP3O75386 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TULP3O75386 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TULP3O75386 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TULP3O75386 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TULP3O75386 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TULP3O75386 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TULP3O75386 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TULP3O75386 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TULP3O75386 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TULP3O75386 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TULP3O75386 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TULP3O75386 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TULP3O75386 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TULP3O75386 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TULP3O75386 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TULP3O75386 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TULP3O75386 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TULP3O75386 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TULP3O75386 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TULP3O75386 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TULP3O75386 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TULP3O75386 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TULP3O75386 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TULP3O75386 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TULP3O75386 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TULP3O75386 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TULP3O75386 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TULP3O75386 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TULP3O75386 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TULP3O75386 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TULP3O75386 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TULP3O75386 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TULP3O75386 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TULP3O75386 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TULP3O75386 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TULP3O75386 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TULP3O75386 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TULP3O75386 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TULP3O75386 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TULP3O75386 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TULP3O75386 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TULP3O75386 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TULP3O75386 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TULP3O75386 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TULP3O75386 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TULP3O75386 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TULP3O75386 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TULP3O75386 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TULP3O75386 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TULP3O75386 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TULP3O75386 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TULP3O75386 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TULP3O75386 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TULP3O75386 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TULP3O75386 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TULP3O75386 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TULP3O75386 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TULP3O75386 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TULP3O75386 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TULP3O75386 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TULP3O75386 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TULP3O75386 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TULP3O75386 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TULP3O75386 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TULP3O75386 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TULP3O75386 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TULP3O75386 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TULP3O75386 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TULP3O75386 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TULP3O75386 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TULP3O75386 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TULP3O75386 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TULP3O75386 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TULP3O75386 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TULP3O75386 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TULP3O75386 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TULP3O75386 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TULP3O75386 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TULP3O75386 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TULP3O75386 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TULP3O75386 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TULP3O75386 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TULP3O75386 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TULP3O75386 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TULP3O75386 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TULP3O75386 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TULP3O75386 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TULP3O75386 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TULP3O75386 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TULP3O75386 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TULP3O75386 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TULP3O75386 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TULP3O75386 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TULP3O75386 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TULP3O75386 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TULP3O75386 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TULP3O75386 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TULP3O75386 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TULP3O75386 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TULP3O75386 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms