Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIN3BO75182 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIN3BO75182 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIN3BO75182 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIN3BO75182 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIN3BO75182 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIN3BO75182 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIN3BO75182 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIN3BO75182 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIN3BO75182 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIN3BO75182 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIN3BO75182 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIN3BO75182 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIN3BO75182 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIN3BO75182 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIN3BO75182 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIN3BO75182 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIN3BO75182 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIN3BO75182 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIN3BO75182 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIN3BO75182 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SIN3BO75182 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIN3BO75182 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIN3BO75182 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIN3BO75182 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIN3BO75182 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIN3BO75182 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIN3BO75182 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIN3BO75182 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIN3BO75182 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIN3BO75182 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIN3BO75182 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIN3BO75182 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIN3BO75182 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIN3BO75182 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIN3BO75182 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIN3BO75182 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SIN3BO75182 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIN3BO75182 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIN3BO75182 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIN3BO75182 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIN3BO75182 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIN3BO75182 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIN3BO75182 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIN3BO75182 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIN3BO75182 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIN3BO75182 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIN3BO75182 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIN3BO75182 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIN3BO75182 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIN3BO75182 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIN3BO75182 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIN3BO75182 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms