Protein–RNA interactions for Protein: O60687

SRPX2, Sushi repeat-containing protein SRPX2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPX2O60687 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRPX2O60687 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRPX2O60687 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRPX2O60687 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRPX2O60687 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRPX2O60687 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SRPX2O60687 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SRPX2O60687 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRPX2O60687 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRPX2O60687 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRPX2O60687 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRPX2O60687 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SRPX2O60687 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRPX2O60687 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRPX2O60687 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRPX2O60687 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRPX2O60687 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRPX2O60687 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRPX2O60687 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRPX2O60687 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRPX2O60687 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRPX2O60687 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRPX2O60687 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRPX2O60687 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRPX2O60687 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRPX2O60687 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRPX2O60687 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRPX2O60687 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRPX2O60687 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRPX2O60687 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SRPX2O60687 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRPX2O60687 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRPX2O60687 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRPX2O60687 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRPX2O60687 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRPX2O60687 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRPX2O60687 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRPX2O60687 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRPX2O60687 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SRPX2O60687 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRPX2O60687 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRPX2O60687 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRPX2O60687 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRPX2O60687 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRPX2O60687 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRPX2O60687 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRPX2O60687 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRPX2O60687 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRPX2O60687 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRPX2O60687 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRPX2O60687 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SRPX2O60687 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRPX2O60687 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRPX2O60687 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRPX2O60687 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRPX2O60687 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRPX2O60687 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRPX2O60687 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRPX2O60687 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRPX2O60687 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRPX2O60687 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRPX2O60687 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRPX2O60687 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRPX2O60687 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRPX2O60687 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRPX2O60687 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRPX2O60687 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRPX2O60687 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRPX2O60687 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRPX2O60687 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRPX2O60687 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRPX2O60687 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRPX2O60687 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRPX2O60687 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRPX2O60687 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SRPX2O60687 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRPX2O60687 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRPX2O60687 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SRPX2O60687 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
SRPX2O60687 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
SRPX2O60687 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SRPX2O60687 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SRPX2O60687 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SRPX2O60687 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SRPX2O60687 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SRPX2O60687 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRPX2O60687 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRPX2O60687 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRPX2O60687 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRPX2O60687 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRPX2O60687 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRPX2O60687 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRPX2O60687 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRPX2O60687 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRPX2O60687 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRPX2O60687 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRPX2O60687 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRPX2O60687 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRPX2O60687 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRPX2O60687 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms