Protein–RNA interactions for Protein: O60664

PLIN3, Perilipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN3O60664 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLIN3O60664 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLIN3O60664 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLIN3O60664 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLIN3O60664 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLIN3O60664 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLIN3O60664 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLIN3O60664 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PLIN3O60664 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLIN3O60664 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLIN3O60664 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLIN3O60664 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLIN3O60664 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLIN3O60664 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PLIN3O60664 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PLIN3O60664 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PLIN3O60664 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PLIN3O60664 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms