Protein–RNA interactions for Protein: O60637

TSPAN3, Tetraspanin-3, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN3O60637 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN3O60637 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN3O60637 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN3O60637 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN3O60637 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN3O60637 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN3O60637 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN3O60637 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN3O60637 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN3O60637 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN3O60637 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN3O60637 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN3O60637 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN3O60637 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN3O60637 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN3O60637 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN3O60637 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN3O60637 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN3O60637 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN3O60637 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN3O60637 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN3O60637 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN3O60637 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN3O60637 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN3O60637 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN3O60637 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN3O60637 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN3O60637 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN3O60637 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN3O60637 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN3O60637 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN3O60637 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN3O60637 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN3O60637 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN3O60637 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN3O60637 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN3O60637 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN3O60637 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN3O60637 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN3O60637 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN3O60637 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN3O60637 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN3O60637 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN3O60637 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN3O60637 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN3O60637 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN3O60637 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN3O60637 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN3O60637 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN3O60637 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN3O60637 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN3O60637 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN3O60637 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN3O60637 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN3O60637 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN3O60637 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN3O60637 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN3O60637 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN3O60637 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN3O60637 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN3O60637 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN3O60637 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN3O60637 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSPAN3O60637 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSPAN3O60637 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSPAN3O60637 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN3O60637 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN3O60637 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN3O60637 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN3O60637 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN3O60637 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN3O60637 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN3O60637 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN3O60637 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN3O60637 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN3O60637 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN3O60637 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN3O60637 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN3O60637 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN3O60637 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN3O60637 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN3O60637 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN3O60637 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN3O60637 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN3O60637 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN3O60637 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN3O60637 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN3O60637 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN3O60637 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN3O60637 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN3O60637 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN3O60637 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN3O60637 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN3O60637 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN3O60637 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN3O60637 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN3O60637 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN3O60637 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN3O60637 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN3O60637 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms