Protein–RNA interactions for Protein: O60337

MARCH6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH6O60337 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MARCH6O60337 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MARCH6O60337 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MARCH6O60337 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MARCH6O60337 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MARCH6O60337 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MARCH6O60337 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MARCH6O60337 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MARCH6O60337 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MARCH6O60337 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MARCH6O60337 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MARCH6O60337 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MARCH6O60337 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MARCH6O60337 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MARCH6O60337 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MARCH6O60337 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MARCH6O60337 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MARCH6O60337 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MARCH6O60337 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MARCH6O60337 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MARCH6O60337 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
MARCH6O60337 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MARCH6O60337 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MARCH6O60337 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MARCH6O60337 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MARCH6O60337 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MARCH6O60337 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MARCH6O60337 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms