Protein–RNA interactions for Protein: O60318

MCM3AP, Germinal-center associated nuclear protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3APO60318 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MCM3APO60318 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCM3APO60318 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCM3APO60318 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCM3APO60318 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCM3APO60318 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCM3APO60318 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCM3APO60318 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCM3APO60318 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MCM3APO60318 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCM3APO60318 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCM3APO60318 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCM3APO60318 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCM3APO60318 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCM3APO60318 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCM3APO60318 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MCM3APO60318 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCM3APO60318 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCM3APO60318 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCM3APO60318 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCM3APO60318 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCM3APO60318 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCM3APO60318 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCM3APO60318 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MCM3APO60318 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MCM3APO60318 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCM3APO60318 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCM3APO60318 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCM3APO60318 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MCM3APO60318 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCM3APO60318 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCM3APO60318 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCM3APO60318 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MCM3APO60318 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCM3APO60318 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCM3APO60318 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCM3APO60318 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCM3APO60318 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCM3APO60318 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCM3APO60318 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCM3APO60318 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCM3APO60318 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCM3APO60318 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCM3APO60318 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCM3APO60318 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCM3APO60318 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCM3APO60318 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCM3APO60318 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCM3APO60318 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCM3APO60318 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCM3APO60318 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCM3APO60318 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MCM3APO60318 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCM3APO60318 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCM3APO60318 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCM3APO60318 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCM3APO60318 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCM3APO60318 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCM3APO60318 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCM3APO60318 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCM3APO60318 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCM3APO60318 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCM3APO60318 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCM3APO60318 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCM3APO60318 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCM3APO60318 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCM3APO60318 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCM3APO60318 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCM3APO60318 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCM3APO60318 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCM3APO60318 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCM3APO60318 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCM3APO60318 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCM3APO60318 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCM3APO60318 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCM3APO60318 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCM3APO60318 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCM3APO60318 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MCM3APO60318 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCM3APO60318 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCM3APO60318 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MCM3APO60318 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCM3APO60318 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCM3APO60318 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCM3APO60318 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCM3APO60318 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCM3APO60318 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCM3APO60318 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCM3APO60318 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCM3APO60318 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MCM3APO60318 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCM3APO60318 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCM3APO60318 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCM3APO60318 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCM3APO60318 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCM3APO60318 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MCM3APO60318 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
MCM3APO60318 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MCM3APO60318 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MCM3APO60318 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms