Protein–RNA interactions for Protein: O43765

SGTA, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTAO43765 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SGTAO43765 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGTAO43765 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SGTAO43765 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGTAO43765 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGTAO43765 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGTAO43765 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGTAO43765 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGTAO43765 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGTAO43765 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGTAO43765 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SGTAO43765 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGTAO43765 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGTAO43765 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGTAO43765 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGTAO43765 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGTAO43765 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SGTAO43765 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGTAO43765 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGTAO43765 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGTAO43765 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGTAO43765 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGTAO43765 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SGTAO43765 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGTAO43765 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGTAO43765 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGTAO43765 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGTAO43765 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGTAO43765 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGTAO43765 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGTAO43765 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGTAO43765 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGTAO43765 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SGTAO43765 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SGTAO43765 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SGTAO43765 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGTAO43765 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGTAO43765 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGTAO43765 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGTAO43765 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGTAO43765 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGTAO43765 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGTAO43765 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGTAO43765 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGTAO43765 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGTAO43765 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGTAO43765 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SGTAO43765 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGTAO43765 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGTAO43765 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGTAO43765 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGTAO43765 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGTAO43765 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGTAO43765 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SGTAO43765 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGTAO43765 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGTAO43765 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGTAO43765 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGTAO43765 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGTAO43765 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGTAO43765 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGTAO43765 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGTAO43765 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGTAO43765 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGTAO43765 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGTAO43765 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGTAO43765 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGTAO43765 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGTAO43765 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGTAO43765 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGTAO43765 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGTAO43765 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGTAO43765 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGTAO43765 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGTAO43765 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGTAO43765 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGTAO43765 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGTAO43765 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGTAO43765 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGTAO43765 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGTAO43765 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGTAO43765 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGTAO43765 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SGTAO43765 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGTAO43765 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGTAO43765 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGTAO43765 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGTAO43765 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGTAO43765 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGTAO43765 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGTAO43765 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGTAO43765 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGTAO43765 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGTAO43765 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGTAO43765 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGTAO43765 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGTAO43765 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGTAO43765 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGTAO43765 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGTAO43765 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms