Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms