Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA2O43364 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA2O43364 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA2O43364 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA2O43364 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA2O43364 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA2O43364 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA2O43364 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA2O43364 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA2O43364 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA2O43364 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA2O43364 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA2O43364 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA2O43364 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA2O43364 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA2O43364 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA2O43364 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA2O43364 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA2O43364 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA2O43364 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA2O43364 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA2O43364 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA2O43364 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA2O43364 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA2O43364 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA2O43364 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA2O43364 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA2O43364 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA2O43364 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA2O43364 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA2O43364 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA2O43364 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXA2O43364 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXA2O43364 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXA2O43364 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXA2O43364 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXA2O43364 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA2O43364 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA2O43364 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA2O43364 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA2O43364 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA2O43364 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA2O43364 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA2O43364 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA2O43364 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA2O43364 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA2O43364 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA2O43364 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA2O43364 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA2O43364 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA2O43364 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA2O43364 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA2O43364 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA2O43364 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA2O43364 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA2O43364 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA2O43364 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA2O43364 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA2O43364 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA2O43364 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA2O43364 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA2O43364 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HOXA2O43364 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA2O43364 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA2O43364 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA2O43364 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA2O43364 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA2O43364 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA2O43364 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA2O43364 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA2O43364 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA2O43364 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA2O43364 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA2O43364 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA2O43364 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA2O43364 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA2O43364 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA2O43364 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA2O43364 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA2O43364 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA2O43364 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA2O43364 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA2O43364 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA2O43364 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA2O43364 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA2O43364 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA2O43364 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA2O43364 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA2O43364 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA2O43364 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA2O43364 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA2O43364 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA2O43364 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA2O43364 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA2O43364 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA2O43364 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA2O43364 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA2O43364 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA2O43364 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA2O43364 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms