Protein–RNA interactions for Protein: O43290

SART1, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SART1O43290 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SART1O43290 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SART1O43290 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SART1O43290 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SART1O43290 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SART1O43290 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SART1O43290 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SART1O43290 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SART1O43290 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SART1O43290 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SART1O43290 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SART1O43290 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SART1O43290 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SART1O43290 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SART1O43290 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SART1O43290 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SART1O43290 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SART1O43290 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SART1O43290 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SART1O43290 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SART1O43290 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SART1O43290 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SART1O43290 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SART1O43290 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SART1O43290 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SART1O43290 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SART1O43290 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SART1O43290 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SART1O43290 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SART1O43290 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SART1O43290 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SART1O43290 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SART1O43290 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SART1O43290 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SART1O43290 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SART1O43290 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SART1O43290 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SART1O43290 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SART1O43290 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SART1O43290 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SART1O43290 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SART1O43290 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SART1O43290 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SART1O43290 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SART1O43290 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SART1O43290 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SART1O43290 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SART1O43290 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SART1O43290 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SART1O43290 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SART1O43290 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SART1O43290 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SART1O43290 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SART1O43290 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SART1O43290 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SART1O43290 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SART1O43290 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SART1O43290 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SART1O43290 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SART1O43290 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SART1O43290 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SART1O43290 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SART1O43290 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SART1O43290 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SART1O43290 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SART1O43290 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SART1O43290 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SART1O43290 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SART1O43290 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SART1O43290 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SART1O43290 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SART1O43290 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SART1O43290 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SART1O43290 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SART1O43290 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SART1O43290 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SART1O43290 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SART1O43290 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SART1O43290 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SART1O43290 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SART1O43290 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SART1O43290 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SART1O43290 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SART1O43290 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SART1O43290 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SART1O43290 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SART1O43290 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SART1O43290 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SART1O43290 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SART1O43290 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SART1O43290 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SART1O43290 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SART1O43290 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SART1O43290 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SART1O43290 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SART1O43290 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SART1O43290 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SART1O43290 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SART1O43290 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SART1O43290 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms