Protein–RNA interactions for Protein: O43174

CYP26A1, Cytochrome P450 26A1, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP26A1O43174 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CYP26A1O43174 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP26A1O43174 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CYP26A1O43174 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP26A1O43174 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP26A1O43174 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP26A1O43174 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP26A1O43174 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP26A1O43174 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP26A1O43174 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP26A1O43174 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP26A1O43174 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP26A1O43174 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms